1290中国艾滋病性病2020年12月第26卷第12期Chin J AIDS STD Vol.26No.12Dec2020 DOI:10.13419/jki.aids.2020.12.06•论著.
王峰，刘佳，黎美芝，阿斯木古丽・阿布来提，李淑华，王静
(克拉玛依市疾病预防控制中心，新疆克拉玛依834000)
摘要：目的了解2008一2017年间新疆克拉玛依市1型艾滋病病毒(HIV-1)感染者基因亚型的分布特点及变化情况。方法通过巢式荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法扩增克拉玛依市HIV-1感染者c”基因的C2〜V3 千万别去云南怒江贡山
区并进行序列测定，通过样本的流行病学资料和系统进化树进行分析：结果2008-2017年克拉玛依市共收集到 HIV-1感染者样本344份，其中扩增阳性且成功获得测序结果169例。根据基因分析共发现6种HIV-1亚型，
杭州到乌镇多远其分布显示CRFO7_BC占72.19%(122例),CRFOl.AE占1L83%(2O例)，C亚型占6.51%(11例),B亚型占4.73%
(8例)，CRFO8_BC占3.55%(6例)和A6亚型占1.18%(2例)。结论克拉玛依市的HIV-1感染者基因亚型
以CRF07_BC为主，且随着时间变化亚型呈多样化趋势，应加强监测HIV・1基因亚型的变化。
关键词：1型艾滋病病毒；基因亚型；序列分析
中图分类号：R512.91；R373.9文献标志码：A 文章编号：1672-5662(2020)12-1290-03
Genotypes of HIV-1infected people in Karamay,Xinjiang from2008to2017WANG Feng,LIU Jia,LI Meizhi,ASIMUGULI-
Abulaiti,LI Shuhua,WANG Jing.(Karamay Center f or Disease Prevention and Control,Karamay834000,Xingjiang,China) Supported by the Project of Karamay Foundation(2017RC001A-02)
Abstract：Objective To understand the distribution characteristics and changes of genotypes of HIV-1infected persons in Karamay,Xinjiang from2008to2017.Methods Nested PCR was used to amplify and sequence the C2-V3
region of the env gene of HIV-1infected people,and to analyze the epidemiological data and phylogenetic tree of the
samples.Results From2008to2017,a total of344HIV-1infected samples were collected in Karamay,of which169
were positive for amplification and sequencing results were successfully obtained.According to env gene analysis,a total
of6HIV-1subtypes were found.The distribution showed that CRF07BC accounted for72.19%(122/169),CRF01AE
for11.83%(20/169),C subtype for6.51%(11/169),B subtype for4.73%(8/169),CRF08_BC for3.55%(6/169)and A6
subtype for1.18%(2/169).Conclusion The genetic subtypes of HIV-1infected people in Karamay are mainly CRF07
BC,and the subtypes shows a diversified trend over time.Therefore,it is necessary to strengthen the monitoring of HIV-
1gene subtypes.
Keywords:HIV-1infection;gene subtype;sequence analysis
艾滋病病毒（HIV）属于反转录病毒，为两条相同单股正链核糖核酸（RNA）病毒，由于其RNA酶缺乏校正活性，具有高度变异特性叫HIV分为HIV-1和HIV-2，目前世界范围内流行的主要是HIV-1O近年来我国HIV-1感染人数不断增加，HIV-1基因亚型也呈现出多样化，同时HIV-1的不同亚型在我国呈不平衡分布。为了解和掌握新疆克拉玛依市HIV感染者的主要亚型和分布特点，对2008一2017年10年间克拉玛
收稿日期：2020-06-28；修回日期：2020-07-15
基金项目：新疆克拉玛依市基金资助项目（2017RC001A-02）
第一作者简介：王峰（1972-），男，主任医师，学士，研究传染病防治。Email：***************依市HIV-1感染者的基因亚型分布及流行情况进行描述分析。
1材料与方法
1.1样本来源收集2008-2017年新疆克拉玛依市新确证的HIV-1感染者留存的血清样本，样本的人口学信息等流行病学资料来自中国疾病预防控制中心艾滋病防治基本信息系统。
1.2方法将血清样本进行序列扩增分析。HIV-1核酸提取及片段扩增使用Qiagen核酸提取试剂盒（QIAamp VrialRNAMini Kit），从血清样本中提取HIV-1RNA，采用巢式聚合酶链反应扩增e”区基因
片段：第—轮扩增用试剂盒（PrimeScript one step RT-PCR,
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TaKaRa），第二轮扩增采用试剂（TaKaRa Ex Taq®DNA Polymerase,TaKaRa），扩增引物及条件参考以往文献报道叫获得的荧光定量聚合酶链反应（PCR）产物经1%琼脂糖电泳鉴定后送上海生工进行序列测定。
使用BioEdit软件对收到序列进行编辑处理，通过LosAlamos HIV database（www.）进行初步的序列分析，并下载参考株序列（K03455_B, AY829211_A6,MK702966_01AE,HQ669198_07BC, HQ669909_07BC,U07102.C,AM886226_08BC）。所有序列通过MEGA6软件中的Neighbor-Joining算法（Bootstrap=1000）进行系统进化树分析。1.3统计方法使用Excel2007整理2008一2017年新疆克拉玛依市HIV-1感染者人口学信息资料，采用SPSS20.0软件进行统计分析。采用描述流行病学方法对资料进行分析，率的比较采用卡方检验°Pv0.05为差异有统计学意义。国内最好的旅行社排名
2结果
2.1人口学特征共收集2008-2017年新疆克拉玛依市新确证感染者样本344例，由于血清样本病毒载量较低.总体扩增阳性率为56.98%（196例）。HIV-1 感染者人口学信息详见表!□
表12008-2017年新疆克拉玛依市HIV-1感染者人口学信息［例数（占比/%）］
郑州园博园有什么好玩的变量病例总数（77=169）2008一2012年
(/7=40)
2013—2017年
(n=129)
才值P值
性别男119(70.41)26(65.00)93(72.09)0.74>0.05
女50(29.59)14(35.00)36(27.91)
年龄/岁18-3034(20.12)8(20.00)26(20.16)0.51>0.05
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31-5090(53.25)23(57.50)67(51.94)
>5145(26.63)9(22.50)36(27.91)
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民族汉族61(36.09)8(20.00)53(41.09) 6.180.045
维吾尔族100(59.17)29(72.50)71(55.04)
其他少数民族8(4.73)3(7.50)5(3.88)
感染途径同性性传播27(15.98)1(2.50)26(20.16)23.520.000
异性性传播132(78.11)31(77.50)101(78.29)
其他10(5.92)8(20.00)2(1.55)
婚姻状况已婚89(52.66)23(57.50)66(51.16)0.81>0.05
离异或丧偶42(24.85)10(25.00)32(24.81)
未婚38(22.49)7(17.50)31(24.03)
文化程度初中及以下65(3&46)23(57.50)42(32.56)8.310.016
高中或中专62(36.69)9(22.50)53(41.09)
大专及以上42(24.85)8(20.00)34(26.36)
2.2样本亚型分布经序列整理后共获得169例发现6种亚型，不同年份HIV-1基因亚型的分布见HIV-1感染者env区片段，通过比对及进化分析共表2。
表22008-2017年新疆克拉玛依市HIV-1感染者基因亚型分布［例数（占比/%）］
年度（病例数）-
CRF07BC CRF08BC
基因亚型
CRF01AE C B A6
2(X)8(/7=9)8(88.89)1(11.11)一-—一
2009(/1=4)3(75.00)一—一1(25.00)一
2010(n=9)7(77.78)一1(11.11)1(11.11)-一
2011(n=8)5(62.50)-1(12.50)一2(25.00)-
2012(/7=10)8(80.00)1(10.00)一—1(10.00)—
2013(/2=15)12(80.00)一1(6.67)1(6.67)1(6.67)—
2014(/7=25)16(64.00)2(8.00)4(16.00)1(4.00)2(8.00)—
2015(n=l7)11(64.71)一5(29.41)1(5.88)——
2016(n=24)16(66.67)一2(8.33)4(16.67)1(4.17)1(4.17)
2017(/7=48)36(75.00)2(4.17)6(12.50)3(6.25)—1(2.08)
合计(n=169)122(72.19)6(3.55)20(11.83)11(6.51)8(4.73)2( 1.18)
2.3系统进化分析CRF07_BC,CRF08_BC和C亚CRF01_AE、A6和B基因距离较大，三种不同基因型型基因距离相对较小，在进化树上处于一个大簇中，别分别形成三个小簇（图1）。
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注：•为参考株；•为CRF07_BC亚型；》为CRF08_BC亚型；•为CRF01_AE亚型；
•为C亚型；▲为B亚型；•为A6亚型；比例尺为基因离散率，
图1新疆克拉玛依市HIV-1感染者基因亚型进化树
3讨论
基于基因序列差异，HIV可以分为若干不同的基因亚型。目前已知的HIV-1M的基因亚型有9种，流行重组型已有1(X)余种，我国报道的HIV-1基肉亚型以CRFO1_AE,CRF07_BC、CRF()8_B(：和B亚型为主要流行亚型XI本研究发现克拉玛依市流行的主要基因亚型为CRF'07_BC流行重组体，这与之前新疆地区报道的HIV-1感染者的主要流行基因亚型一致|5-\但是克拉玛依市流行的HIV-1基因亚型更加复杂和多样.特别是CRFO1_AE重组体占比在2013—2017年明显高于2008-2012年，尤其在2015年CRF01_AE 重组体的比例高，说明克拉玛依市流行亚型已并不单一。此外，根据文献报道HIV-1基因亚型与传播途径相关吟叫而在本研究发现，克拉玛依市流行的HIV-1基因亚型不仅与传播途径有关联，而且在不同民族、不同文化程度人中也有差异。
本研究对象为2008-2017年克拉玛依市新确证的HIV感染者样本，虽然受限于样本质量，扩增效率并不高，但是采用整抽样的方法已基本涵盖了本地所有的HIV-1感染者。因此，本研究结果具有很好的代表性：本研究中分析基因亚型是基于HIV的env区，由于扩增区域单一，可能会有新的重组体被忽略.同时由于扩增片段较短，可能会造成部分亚型分型不够精准，因此下一步将对H1V的gag.pol,env三个区进行综合分析，以便获得更加精准的HIV-1基因亚型本研究中发现2013—2017年H1V基因亚型相对2
008—2012年更加复杂，从2013一2017年和2008-2012年在感染途径上的差别可以看出，同性性传播的比例上升，提示感染途径的变化可能是引起基因亚型变化的因素。而且2013-2017年和2008—2012年在民族上的差别可以看出，汉族比例上升.维吾尔族比例下降，提示有外地输入病例的可能：因此，艾滋病防治工作在健康宣教、干预策略上需要关注男男同性恋人。本研究结果初步探索了新疆克拉玛依市HIV-1感染者中HIV流行规律，仍需加强HIV分子亚型研究及进一步进行分子网络分析
参考文献：
[1]Hemelaar J.Implications of HIV diversity for the HIV-1pandemic[J].
Journal of Infection,2013,6(5):391—400.
[2]李巧敏，赵宏儒.赵翠英，等.河北省2(X)8年HIVJ感染者分子
流行病学研究[J].河北医药,2010,32(16):2156-2158.
[3]苏迎盈•刘慧鑫，吴静.等.中国HIV・1基因亚型分布及流行趋势
[J].中华流行病学杂志,2014,35(10):1164-1168.
[4]陶艳琳，赵雪涛，汤宇帆，等.2000一2012年中国HIV基因亚型时
空分布的系统综述卩|•中华疾病控制杂志.2013,17(12):1073-1082. [5]厳永慧，王莉.何翠，等.2010-2013年新噩HIV亚型和耐药传
播研究[J].中国艾滋病性病,2015,21(1):20-23.
⑹刘晓明.艾德尔艾力•阿有甫.张靖、等•新疆和田地区新近诊断
HI\-1人耐药传播及亚型分布情况调査[J].安徽预防医学杂志，2016,22(6):371-374.
⑺米吉提•买买提.艾尼，周素娟.等•维吾尔族HI\-1感染者gag
基因序列分型研究|J|.实用预防医学,2013,20(9):1038-1040. [8]郑强，王静，董言，等.2004一2015新疆艾滋病监测数据分析[J].
疾病预防控制通报,2017.32(1)：34-38.
[9]YU J.Lincai Z.Zongjie H,et al.Prevalence of Different Genotypes of
Hl\-1in Injection Drug I sers in China:A Systematic and Mrta—AnalvsisfJ].Current HIX research,2019,17(4):240-257.
[10]xinli1.Junjuan Z. al.Large transmission clusters of
HIX—1main genotypes among HIX-1individuals before antiretroviral therapy in Hebei province,China|J|.AIDS Research and Human Belroviruses.2019.36(5):
199-21().
